Своё начало этот жанр берёт ещё в древней японской литературе. Вспомним сказку о рыбаке Урасиме Таро, который спас черепаху, а она в благодарность перенесла его в удивительный подводный мир. Похожий сюжет встречается и в Древней Руси, в сказке о гусляре Садко, который своей игрой впечатлил морского царя и попал в подводное царство. Чем вам не исекай?
Знаковым произведением в истории жанра, заложившим его черты и основы, стало ранобэ (японский роман) Харуки Такачихо Isekai no Yuushi, что переводится как «Герой потустороннего мира». Именно благодаря этой работе в 1979 году за жанром закрепилось общеизвестное название — исекай.
В 2000-х годах вышли ранобэ и одноимённый аниме-сериал «Подручный Луизы-Нулизы». История о приключениях попаданца из другого мира и девушки по имени Луиза настолько полюбилась публике, что сделала жанр исекай популярным среди веб-романов и аниме-адаптаций.
Однако настоящий переломный момент случился в 2012 году после выхода аниме Sword Art Online — «Мастера меча онлайн». Сериал стал адаптацией одноимённого ранобэ японского писателя Рэки Кавахары. Автор с 2002 года публиковал историю на своём веб-сайте, но именно релиз аниме принёс ему мировую известность. Сюжет рассказывает о геймерах, которые застряли в виртуальном мире ММО-игры. Герои должны дойти до конца и убить финального босса, но быть при этом очень осторожными, ведь смерть в игре означает смерть и в реальной жизни.
Невероятный успех «Мастеров меча онлайн» трансформировал жанр в новом направлении так называемого неоисекая. Если раньше герои попадали в волшебные и загадочные фэнтези-вселенные, то теперь для них открылся совершенно неизведанный мир видеоигр. Это стало поводом для экспериментов, со временем значительно повлиявших на жанр.
Так появились популярные аниме: «Повелитель», «Re: Zero — жизнь с нуля в другом мире», «О моём перерождении в слизь», «Восхождение героя щита», «Реинкарнация безработного: История о приключениях в другом мире» и многие другие.